15 minutos. Investigadores del Instituto español de Salud Carlos III han conseguido el primer borrador de la secuencia completa del virus causante de la viruela del mono (Monkey pox) que circula en España a partir de las muestras de 23 pacientes.
Lo logró un equipo del Laboratorio de Arbovirus y de las Unidades de Genómica y Bioinformática de este Instituto, dependiente del Ministerio de Ciencia e Innovación. El resultado permitirá hacer análisis más avanzados para obtener datos sobre su comportamiento y comprender mejor su origen, circulación y difusión.
La secuencia completa confirmó que el brote del virus de la viruela del mono que se está produciendo en España pertenece a un grupo fitogenético de África Occidental. Se trata del de menor virulencia entre los conocidos y el que se ha identificado por el momento en la mayoría de los países fuera de África implicados en esta ola.
Según informó este jueves el Instituto de Salud Carlos III, es una de las secuencias más completas que se han obtenido hasta el momento. Permite, además, alcanzar una cobertura del 100 % de los 190 mil pares de bases del genoma de este virus.
La secuenciación llevada a cabo a través del Laboratorio de Arbovirus del ISCIII, en colaboración con las unidades de Genómica y Bioinformática, contó con las referencias publicadas en los últimos días por otros países (Bélgica, Alemania, Portugal y Estados Unidos). Se basó en una tecnología genómica de nueva generación.
A esa tecnología se suma un análisis complementario de las muestras mediante una técnica conocida como “ensamblado de novo”, precisó el Instituto.
Las secuencias en crudo se terminaron de obtener el pasado lunes por la noche. El análisis de computación se completó en las últimas 36 horas.
Más análisis
Según los resultados, las muestras secuenciadas parecen pertenecer al mismo brote detectado en otros países europeos. Los genomas obtenidos apenas difieren de los ya secuenciados en otros países. En concreto, el análisis realizado en el ISCIII concluyó que hay muy pocas diferencias respecto a la secuenciación llevada a cabo en Alemania.
La secuenciación confirma que el virus de la viruela del mono del brote que se está produciendo en España pertenece al “clado” -variante- de África Occidental.
Los “clados”, informó el Instituto, son grupos filogenéticos que definen la evolución biológica de un organismo, que explican cómo actúa y se comporta. En ellos se pueden observar las diferencias genéticas de los virus circulantes.
Tras obtener la secuencia completa del virus, varios equipos de investigadoras del ISCIII están ahora llevando a cabo análisis filogenéticos para conocer la relación entre las muestras españolas y las de otros países.
La información que obtengan se enfrentará a las ya conocidas y depositadas en bases de datos internacionales para evaluar el grado de identidad. En su caso, la localización de las diferencias que pudieran existir entre la secuencia española y los demás datos internacionales.
Todo esto, destacó el Instituto, permitirá realizar los estudios de trazabilidad del brote, así como identificar potencialmente su origen.
